7_Plateforme de Génomique Fonctionnelle

Le site N-GERE de la plateforme de Génomique Fonctionnelle a été créée en 2011 et elle met à disposition de la communauté scientifique académique et industrielle des ressources de haute technologies sur le campus Médecine-Santé de la faculté de Médecine à Vandoeuvre-Les-Nancy.

Actuellement, la plateforme vous propose :

  • Gènotypage de SNPs de 3000 à plus de 5 millions de loci : essai Infinium HD (Haute Densité) – Illumina
  • Etude de la méthylation du génome humain sur biopuce : Infinium MethylationEPIC – Illumina (> 850 000 loci CpG /échantillon)
  • Techniques pour la préparation de banques ADN et leurs séquençage :
    • Sur gènes ciblés (capture Haloplex 1 kb à 5 Mb ; TruSight One Sequencing panel)
    • Séquençage de novo Génomes entiers (micro-organismes)

N’hésitez pas à nous contacter !


Contacts

Responsable scientifique : Pr. Jean-Louis Guéant

  • Adresse : INSERM Unité 954 – NGERE, Faculté de Médecine – Bâtiment C 2ème étage, 9 Avenue de la Forêt de Haye, BP 20199 – 54505 Vandoeuvre les Nancy
  • Téléphone : 03.83.68.32.71 (bureau) / 03.83.68.32.92 (secrétariat)

Responsable technique : Dr. Céline Chery

  • Adresse : INSERM Unité 954 – NGERE, Faculté de Médecine – Bâtiment C 2ème étage, 9 Avenue de la Forêt de Haye – BP 20199 – 54505 Vandoeuvre les Nancy
  • Téléphone : 03.83.68.33.02 (bureau) / 03.83.68.32.92 (secrétariat)

Les étapes de votre projet

  1. Discussion de la conception du projet et des procédures expérimentales
  2. Etablissement d’un devis
  3. Renvoi du devis signé
  4. Dépôt des échantillons ADN sur la plateforme
  5. Contrôle qualité de vos échantillons
  6. Réalisation des analyses
  7. Aide à l’analyse bioinformatique (si demandée)
  8. Rapport final

Mots clés

Next Generation Sequencing, Methylation and Genotyping


Principaux équipements

Appareils de séquençage iScan et Miseq (Illumina)

iscan

i-Scan (Illumina)

Miseq-personal-sequencer

Miseq (Illumina)

Qualité des banques de séquençage

Sonicateur ADN

agilent 2100 bioanalyzer 2

Bioanalyzer 2100 (Agilent)

Covaris M220 Focused-ultrasonicator

Sonicateur M220 (Covaris)


Conditions d’accès

La plateforme est ouverte à la communauté scientifique académique et industrielle.

Elle est à votre disposition pour vous aider et vous accompagner de A à Z dans tous vos projets de séquençage.

La plateforme dispose d’une tarification différentielle (membres FR3209, laboratoires académiques et partenaires industriels).


Tarifs (applicables au 1er avril 2016)


Publications