1_Plateforme de Séquençage à haut-débit (NGS)

 La plateforme de séquençage à haut-débit de la FR3209 a été créée en septembre 2012 et elle met à disposition de la communauté scientifique académique et industrielle des ressources de haute technologies sur le campus Médecine-Santé de la faculté de Médecine à Vandoeuvre-Les-Nancy.

NGSElle propose des prestations et services variés de haute qualité (de la prestation de routine à la collaboration) pour vos projets de génomique et transcriptomique.

Actuellement, la plateforme vous propose :

  • Une large gamme de techniques pour la préparation de banques ADN et ARN et leur séquençage.
  • Des analyses bioinformatiques (définies en fonction des besoins des utilisateurs.

N’hésitez pas à nous contacter ! et à télécharger notre Plaquette_NGS_2016 !


Contacts

Biopôle, Campus Faculté de Médecine, Vandoeuvre les Nancy

Responsable scientifique : Pr. Iouri Motorine (PR1, UL)

  • Adresse : Bâtiment BioPôle, Laboratoire Ingénierie Moléculaire et Physiopathologie Articulaire (IMoPA)
    UMR 7365 CNRS-UL, Faculté de Médecine, Université de Lorraine, 9 Avenue de la Forêt de Haye, BP 20199 – 54505 Vandoeuvre les Nancy
  • Téléphone : 03.72.74.66.29

Responsable technique : Dr. Virginie Marchand (IR2, UL)

  • Adresse : Bâtiment BioPôle, Fédération de Recherche FR3209, Faculté de Médecine,
    9 Avenue de la Forêt de Haye, BP 20199 – 54505 Vandoeuvre les Nancy
  • Téléphone : 03.72.74.66.67 (bureau) / 03.72.74.66.74 (plateforme)

Les étapes de votre projet

  1. Discussion de votre projet avec les membres de la plateforme
  2. Etablissement d’un devis
  3. Renvoi du devis signé
  4. Dépôt de vos échantillons ARN / ADN sur la plateforme
  5. Contrôle qualité de vos échantillons
  6. Construction des librairies de séquençage
  7. Séquençage
  8. Analyse bioinformatique (si demandée)
  9. Rapport final aux utilisateurs

Mots clés

Next Generation Sequencing, RNA-seq, small RNA-seq, Exome (capture), RiboMethSeq, Ribosome profiling


Principaux équipements

Appareils de séquençage Hiseq et Miseq (Illumina)

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Hiseq 1000 (Illumina)

Miseq-personal-sequencer

Miseq (Illumina)

Qualité des ARN et banques de séquençage

Electrophorèse automatisée sur agarose

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Bioanalyzer 2100 (Agilent)

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PippinPrep (Sage Science)

Sonicateur ADN

Covaris M220 Focused-ultrasonicator

Ultrasonicateur M220 (Covaris)


Conditions d’accès

La plateforme est ouverte à la communauté scientifique académique et industrielle.

Elle est à votre disposition pour vous aider et vous accompagner de A à Z dans tous vos projets de séquençage.

La plateforme dispose d’une tarification différentielle (membres FR3209, laboratoires académiques et partenaires industriels).


Tarifs (applicables au 1er avril 2016)


Publications